Чешская Республика (вместе с Венгрией и Польшей) вошли в первую группу государств бывшего социалистического лагеря, присоединившихся к НАТО после падения берлинской стены и окончания «холодной войны».
Уже в 1989 году Чехословакия свернула с пути социалистического развития в результате «бархатной революции», приведшей в 1993 году к мирному разделу страны на два государства - Чехию и Словакию. В том же году Чехия, как независимое государство, была принята в Североатлантический совет сотрудничества. С этого момента цель присоединения к НАТО прочно заняла свое место во внешнеполитической стратегии Чешской Республики. В 1994 году начинается взаимодействие между Чехией и НАТО в рамках программы "Партнерство ради мира".
С 1995 года чешский воинский контингент принимает участие в операции по поддержанию мира в Боснии и Герцеговине, проводимой под эгидой НАТО. В этот же период времени альянс проводит и публикует результаты исследований по вопросам возможного расширения Североатлантического союза, в котором делается вывод, что данный процесс будет способствовать укреплению стабильности на евро-атлантическом пространстве. Уже с первых заявлений Запада о возможном расширении Североатлантического альянса на Восток, Чехия находилась в числе наиболее вероятных кандидатов на вступление в альянс. Этому способствовало активное участие МИД и министерства обороны Чешской республики, которые всегда оперативно, качественно и, в большинстве случаев, первыми среди стран-кандидатов готовили соответствующие документы и осуществляли все необходимые шаги, которые требовались для вступления в НАТО.
В 1996 году правительство Чехии создало рабочий комитет по вопросам интеграции в НАТО. В 1997 году саммит альянса в Мадриде «дал добро» Чехии, Венгрии и Польше на присоединение к блоку. В апреле 1998 года чешский парламент проголосовал за вступление страны в НАТО. 12 марта 1999 года, после передачи соответствующих документов на хранение Вашингтону, Чехия официально стала членом Североатлантического альянса.
Поддержка местным населением решения о вступлении Чехии в НАТО ярко отражает, в целом, позитивные последствия данного шага для чешской экономики. Следует отметить, что в момент непосредственного принятия этой страны в НАТО уровень поддержки был чрезвычайно низким (в 1997 году вступление Чешской Республики в альянс поддерживало лишь 37% населения), но спустя 3-4 года он серьезно вырос. Официальные цели вступления Чехии в альянс – окончательная интеграция в европейскую цивилизацию и забота о собственной безопасности.
В НАТО чешские военнослужащие специализируются в вопросах защиты от оружия массового уничтожения (ОМУ). Знаменитое элитное подразделение чешских вооруженных сил - 31 бригада по радиационной, химической и биологической обороне активно участвует в разных заграничных миссиях. Еще одна специализация чешских военных в альянсе - это пассивное отслеживание целей в воздухе и на море. В этой области Чехия располагает и промышленной базой. Компания ERA Pardubice, например, выпускает пассивные отслеживающие системы VERA. Чехия также является единственной страной НАТО, обладающая лицензией на обслуживание советских и российских вертолетов, которые активно используются странами альянса и их союзниками в миссии в Афганистане.
Чешские вооруженные силы представлены в операциях НАТО, в основном, сухопутными войсками. Наиболее известными являются миссии чешской роты химзащиты в иракских операциях и Афганистане. В то же время, есть сведения и об участии чешского спецназа в боях в Афганистане против исламского движения «Талибан». Чешские военнослужащие также находятся в составе сил КФОР в Косово и выполняли задачи в многонациональном контингенте «Юго-Восток» в Ираке.
За период членства Чехии в НАТО были коренным образом модернизированы военно-воздушные силы этой страны, практически заново были отстроены военные аэродромы в Чаславе и Намнести-над-Ославоу.
В настоящее время Чехия является активным членом НАТО и достаточно влиятельным, прежде всего, в постсоветской зоне. Она служит примером удачной интеграции бывшего противника альянса в Североатлантический союз, как с военной, так и с экономической точек зрения.